Philippe Malfeyt begon luit te studeren als autodidact, volgde enkele cursussen in het buitenland bij K. Junghänel, A. Bailes en H. Smith en behaalde in 1983 het luitdiploma aan de Royal College of Music te Londen. Malfeyt doceert aan het Conservatorium te Gent en het Lemmeninstituut te Leuven. Hij speelt niet alleen solo maar is ook een veel gevraagd continuospeler in diverse ensembles. Hij stichtte een eigen ensemble in 1989, Romanesque, dat zich toelegde op het renaissancerepertoire en internationaal erkenning oogstte.
Vandaag is Malfeyt vooral actief met het trio Luthomania waar drie luitspelers uit drie verschillende culturen met elkaar in dialoog gaan in eigen composities en improvisaties. Hij nam deel aan tientallen cd-opnamen voor Ricercar, Erato, Vanguard, Sony en andere labels.